The Lancet qui publie cette semaine la première analyse complète de l'impact mondial de la résistance aux antimicrobiens (RAM) estime que la résistance a causé 1,27 million de décès en 2019, et que les infections résistantes aux antimicrobiens ont joué un rôle dans 4,95 millions de décès.
Les estimations pour 204 pays et territoires confirment que la RAM est une menace sanitaire mondiale, avec les pires impacts dans les pays à revenu faible et intermédiaire (PRFM), mais les pays à revenu plus élevé sont également confrontés à des niveaux alarmants de RAM.
L'investissement rapide dans de nouveaux traitements, l'amélioration des mesures de contrôle des infections et l'utilisation optimisée des antibiotiques sont autant de mesures qui peuvent aider les pays à protéger leurs systèmes de santé contre la menace de la RAM.
L'analyse de 204 pays et territoires, publiée dans The Lancet, révèle que la RAM est désormais une cause majeure de décès dans le monde, plus importante que le VIH/sida ou le paludisme. Elle montre que des centaines de milliers de décès sont dus à des infections courantes, auparavant traitables, telles que les infections des voies respiratoires inférieures et du sang, parce que les bactéries qui les provoquent sont devenues résistantes aux traitements.
Le rapport souligne l'urgence d'intensifier la lutte contre la résistance aux antimicrobiens et propose aux décideurs politiques des mesures immédiates qui permettront de sauver des vies et de protéger les systèmes de santé. Il s'agit notamment d'optimiser l'utilisation des antibiotiques existants, de prendre des mesures plus importantes pour surveiller et contrôler les infections, et de fournir davantage de fonds pour développer de nouveaux antibiotiques et traitements.
Le professeur Chris Murray, coauteur de l'étude et membre de l'Institute for Health Metrics and Evaluation de l'université de Washington (États-Unis), a déclaré : « Ces nouvelles données révèlent la véritable ampleur de la résistance aux antimicrobiens dans le monde, et constituent un signal clair que nous devons agir maintenant pour combattre la menace. Les estimations précédentes prévoyaient 10 millions de décès annuels dus à la résistance aux antimicrobiens d'ici 2050, mais nous savons maintenant avec certitude que nous sommes déjà bien plus proches de ce chiffre que nous ne le pensions. Nous devons exploiter ces données pour rectifier le tir et stimuler l'innovation si nous voulons rester en tête de la course contre la résistance aux antimicrobiens. »
Le nouveau rapport Global Research on Antimicrobial Resistance (GRAM) estime les décès liés à 23 agents pathogènes et 88 combinaisons agent pathogène-médicament dans 204 pays et territoires en 2019. La modélisation statistique a été utilisée pour produire des estimations de l'impact de la RAM dans tous les endroits - y compris ceux qui ne disposent pas de données - en utilisant 471 millions de dossiers individuels obtenus à partir d'examens systématiques de la littérature, de systèmes hospitaliers, de systèmes de surveillance et d'autres sources de données.
La charge de morbidité a été estimée de deux façons : les décès causés directement par la RAM (c'est-à-dire les décès qui ne seraient pas survenus si les infections avaient été sensibles aux médicaments et donc plus faciles à traiter) et les décès associés à la RAM (c'est-à-dire lorsqu'une infection résistante aux médicaments a été impliquée dans les décès, mais que la résistance elle-même peut ou non en être la cause directe). Les décès causés par et associés à la RAM ont été calculés pour 204 pays et territoires et rapportés pour 21 régions mondiales et sept superrégions.
On rappellera pour comparaison que le VIH/sida et le paludisme ont causé 860 000 et 640 000 décès, respectivement, en 2019.
La résistance aux médicaments dans les infections des voies respiratoires inférieures - comme la pneumonie - a eu le plus grand impact sur la charge de morbidité de la RAM, causant plus de 400 000 décès et associée à plus de 1,5 million de décès. La résistance aux médicaments dans les infections du sang - qui peuvent conduire à la septicémie, une maladie potentiellement mortelle - a causé environ 370 000 décès et a été associée à près de 1,5 million de décès. La résistance aux médicaments dans les infections intra-abdominales (généralement causées par l'appendicite) a entraîné directement quelque 210 000 décès et a été associée à environ 800 000 décès.
Bien que la résistance aux antimicrobiens constitue une menace pour les personnes de tous âges, les jeunes enfants sont particulièrement exposés, puisqu'environ un décès sur cinq attribuable à la résistance aux antimicrobiens survient chez les enfants de moins de cinq ans.
On estime que les décès causés directement par la RAM sont les plus élevés en Afrique subsaharienne et en Asie du Sud, avec respectivement 24 décès pour 100 000 habitants et 22 décès pour 100 000 habitants. La RAM était associée à 99 décès pour 100 000 en Afrique subsaharienne et à 77 décès pour 100 000 en Asie du Sud. Dans les pays à revenu élevé, la RAM a entraîné directement 13 décès pour 100 000 habitants et a été associée à 56 décès pour 100 000 habitants. (Pour les données régionales, voir le tableau 3 de l'article).
Sur les 23 agents pathogènes étudiés, la résistance aux médicaments de six d'entre eux seulement (E. coli, S. aureus, K. pneumoniae, S. pneumoniae, A. baumannii et P. aeruginosa) a entraîné directement 929 000 décès et a été associée à 3,57 millions de décès. Une combinaison pathogène-médicament - S. aureus résistant à la méthicilline, ou SARM - a directement causé plus de 100 000 décès en 2019, tandis que six autres ont causé chacun entre 50 000 et 100 000 décès.
Tous agents pathogènes confondus, la résistance à deux classes d'antibiotiques souvent considérées comme la première ligne de défense contre les infections graves - les fluoroquinolones et les bêta-lactamines - était à l'origine de plus de 70 % des décès causés par la RAM, selon les estimations.
L'impact des agents pathogènes sur la santé varie considérablement en fonction du lieu, les décès attribuables à la RAM en Afrique subsaharienne étant le plus souvent causés par S. pneumonia (16 % des décès) ou K. pneumonia (20 %), tandis qu'environ la moitié des décès attribuables à la RAM dans les pays à revenu élevé étaient causés par S. aureus (26 %) ou E. coli (23 %).
« La résistance variant considérablement d'un pays et d'une région à l'autre, il est essentiel d'améliorer la collecte de données à l'échelle mondiale pour nous aider à mieux suivre les niveaux de résistance et fournir aux cliniciens et aux décideurs les informations dont ils ont besoin pour relever les défis les plus urgents posés par la résistance aux antimicrobiens. Nous avons identifié de graves lacunes en matière de données dans de nombreux pays à faible revenu, ce qui souligne la nécessité d'accroître la capacité des laboratoires et la collecte de données dans ces pays », a déclaré le professeur Christiane Dolecek, co-auteur de l'étude et responsable scientifique du GRAM au Centre de médecine tropicale et de santé mondiale de l'Université d'Oxford et à l'Unité de recherche en médecine tropicale de Mahidol Oxford (MORU).
Les auteurs reconnaissent certaines limites à leur étude. La disponibilité des données pour certaines parties du monde, en particulier de nombreux PRFM, peut limiter la précision des estimations dans ces endroits, car cela a nécessité la formulation de fortes hypothèses méthodologiques dans l'analyse. La combinaison et la standardisation de données provenant d'une grande variété de sources ont également conduit à certaines sources potentielles de biais, y compris une classification erronée des infections acquises dans la communauté ou à l'hôpital, et une incohérence dans la distinction entre les infections résistantes aux médicaments et les infections sensibles. Il existe également un risque de biais de sélection dans les systèmes de surveillance passive, et les données microbiennes hospitalières des PFR-PRI peuvent être orientées vers des populations plus urbaines ou des maladies plus graves.
Dans un commentaire, le Dr Ramanan Laxminarayan, du Center for Disease Dynamics, Economics & Policy (États-Unis), qui n'a pas participé à l'étude, a déclaré : « Après avoir été un problème méconnu et caché, une image plus claire du fardeau de la RAM émerge enfin. Même le chiffre le plus bas de 911 000 décès estimé par Murray et ses collègues est plus élevé que le nombre de décès dus au VIH, qui attire près de 50 milliards de dollars chaque année. Cependant, les dépenses mondiales consacrées à la lutte contre la RAM sont probablement bien inférieures à ce chiffre. Il faut que cela change. Les dépenses doivent être consacrées à la prévention des infections, à l'utilisation appropriée et judicieuse des antibiotiques existants et à la mise sur le marché de nouveaux antibiotiques. Les responsables sanitaires et politiques aux niveaux local, national et international doivent prendre au sérieux l'importance de la lutte contre la RAM et le défi que représente le manque d'accès à des antibiotiques efficaces et abordables. »
Source The Lancet DOI:https://doi.org/10.1016/S0140-6736(21)02724-0
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