Quelle est, au sein du microbiote, la diversité des bactériophages, ces virus infectant les bactéries ? Si leur rôle dans la flore intestinale était admis, aucune taxonomie n'existait. Des chercheurs britanniques décrivent la Gut Phage Database : une collection d'environ 142 000 génomes viraux d'après 28 060 métagénomes intestinaux venant du monde entier. Environ 36 % des clusters viraux ne sont pas restreints à une seule espèce bactérienne, ce qui crée un flux de gènes entre des bactéries très différentes. La diversité virale est la plus élevée dans la souche bactérienne Firmicutes. Quelque 280 clusters viraux sont retrouvés sur les cinq continents avec des phages hautement prévalents, tels le p-crAssphage et le tout récent Gubaphage.
L. Camarillo-Guerrero et al. Cell, 2021. doi.org/10.1016/j.cell.2021.01.029
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